Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q6DFW0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q6DFW0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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