Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmcc1Q69ZZ6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms