Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ric1Q69ZJ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ric1Q69ZJ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms