Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna3Q65CL1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms