Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pan3Q640Q5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pan3Q640Q5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pan3Q640Q5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pan3Q640Q5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms