Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Zfp248Q640N4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Zfp248Q640N4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Zfp248Q640N4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp248Q640N4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp248Q640N4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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