Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lcn3Q62471 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lcn3Q62471 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lcn3Q62471 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lcn3Q62471 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lcn3Q62471 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lcn3Q62471 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lcn3Q62471 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lcn3Q62471 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Lcn3Q62471 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lcn3Q62471 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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