Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sp4Q62445 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp4Q62445 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms