Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nptx1Q62443 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nptx1Q62443 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms