Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrhQ62361 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrhQ62361 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TrhQ62361 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TrhQ62361 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms