Protein–RNA interactions for Protein: Q62313

Tgoln1, Trans-Golgi network integral membrane protein 1, mousemouse

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgoln1Q62313 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tgoln1Q62313 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tgoln1Q62313 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tgoln1Q62313 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tgoln1Q62313 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgoln1Q62313 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tgoln1Q62313 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Tgoln1Q62313 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgoln1Q62313 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgoln1Q62313 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgoln1Q62313 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms