Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ss18Q62280 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ss18Q62280 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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