Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SspnQ62147 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SspnQ62147 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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