Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrn1Q61809 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrn1Q61809 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrn1Q61809 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrn1Q61809 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn1Q61809 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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