Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes3Q61657 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms