Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Foxd3Q61060 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxd3Q61060 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms