Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdkn2dQ60773 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkn2dQ60773 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms