Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim38Q5SZ99 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Trim38Q5SZ99 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Trim38Q5SZ99 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Trim38Q5SZ99 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim38Q5SZ99 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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