Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TefmQ5SSK3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms