Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sfmbt2Q5DTW2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms