Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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Rtl5Q5DTT4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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Rtl5Q5DTT4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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Rtl5Q5DTT4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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Rtl5Q5DTT4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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Rtl5Q5DTT4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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Rtl5Q5DTT4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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Rtl5Q5DTT4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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Rtl5Q5DTT4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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Rtl5Q5DTT4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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