Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam208bQ5DTT3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fam208bQ5DTT3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms