Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnaaf3Q3UYV8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms