Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Obox3Q3UT54 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms