Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitpnm3Q3UHE1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitpnm3Q3UHE1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms