Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trip13Q3UA06 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trip13Q3UA06 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trip13Q3UA06 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms