Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ssbp4Q3U4B1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ssbp4Q3U4B1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ssbp4Q3U4B1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ssbp4Q3U4B1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssbp4Q3U4B1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ssbp4Q3U4B1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssbp4Q3U4B1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ssbp4Q3U4B1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssbp4Q3U4B1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Ssbp4Q3U4B1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ssbp4Q3U4B1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ssbp4Q3U4B1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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