Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
InipQ3TXT3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
InipQ3TXT3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms