Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt2Q3TTY5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt2Q3TTY5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms