Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pdlim7Q3TJD7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdlim7Q3TJD7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms