Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prr27Q3SYJ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms