Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myo3bQ1EG27 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myo3bQ1EG27 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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