Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd3Q14AI6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpusd3Q14AI6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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