Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ttc39dQ0VF76 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttc39dQ0VF76 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms