Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700061G19RikQ08EE8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700061G19RikQ08EE8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms