Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tff1Q08423 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tff1Q08423 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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