Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnn2Q08093 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms