Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
NrepQ07475 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
NrepQ07475 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms