Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdf3Q07104 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms