Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SrstQ06666 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SrstQ06666 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms