Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk16Q04735 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk16Q04735 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms