Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cxcr5Q04683 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cxcr5Q04683 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms