Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ascl1Q02067 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ascl1Q02067 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms