Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VcpQ01853 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VcpQ01853 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms