Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Serpina1cQ00896 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Serpina1cQ00896 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Serpina1cQ00896 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Serpina1cQ00896 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Serpina1cQ00896 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Serpina1cQ00896 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Serpina1cQ00896 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms