Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gabpb1Q00420 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gabpb1Q00420 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms