Protein–RNA interactions for Protein: P82349

Sgcb, Beta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcbP82349 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcbP82349 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SgcbP82349 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SgcbP82349 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SgcbP82349 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SgcbP82349 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcbP82349 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcbP82349 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms