Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Irx1P81068 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx1P81068 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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