Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct7P80313 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cct7P80313 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cct7P80313 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms