Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atp8a1P70704 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atp8a1P70704 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms